Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf123Q5XPI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf123Q5XPI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms