Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc125Q5U465 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms