Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NotoQ5TIS6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NotoQ5TIS6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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