Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bbs12Q5SUD9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bbs12Q5SUD9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms