Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sco1Q5SUC9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sco1Q5SUC9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms