Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam71bQ5STT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms