Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arhgap44Q5SSM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arhgap44Q5SSM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms