Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TefmQ5SSK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms