Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Utp18Q5SSI6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms