Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zfp36l3Q5ISE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp36l3Q5ISE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms