Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nlrc3Q5DU56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nlrc3Q5DU56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms