Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

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Length 618 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnma5Q5DTT8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pnma5Q5DTT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnma5Q5DTT8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnma5Q5DTT8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnma5Q5DTT8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms