Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufaf2Q59J78 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms