Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ankrd28Q505D1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd28Q505D1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms