Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otol1Q4ZJM7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otol1Q4ZJM7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms