Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr18Q4VBE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr18Q4VBE8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms