Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc3lQ4KL14 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms