Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
6430531B16RikQ3V2J1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms