Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Krtap1-4Q3V2D6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Krtap1-4Q3V2D6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms