Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc185Q3V118 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc185Q3V118 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287 ms