Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaaf3Q3UYV8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms