Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc160Q3UYG1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms