Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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D130052B06RikQ3UW13 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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D130052B06RikQ3UW13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D130052B06RikQ3UW13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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D130052B06RikQ3UW13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D130052B06RikQ3UW13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D130052B06RikQ3UW13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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