Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtl4Q3URY0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms