Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms