Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa3Q3UPR0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms