Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Skap2Q3UND0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skap2Q3UND0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms