Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem253Q3UNB8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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