Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cln5Q3UMW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms