Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hdgfl2Q3UMU9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms