Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrch2Q3UMG5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms