Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc33Q3ULW6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms