Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mccc2Q3ULD5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms