Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc61Q3UJV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc61Q3UJV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms