Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Edc4Q3UJB9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Edc4Q3UJB9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms