Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b2Q3UJB0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms