Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitpnm3Q3UHE1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms