Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms