Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf166Q3U9F6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf166Q3U9F6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms