Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cops9Q3U898 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms