Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms