Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenplQ3U3S3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenplQ3U3S3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms