Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms