Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms