Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc17a7Q3TXX4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms