Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tamm41Q3TUH1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tamm41Q3TUH1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms