Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms