Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cwc27Q3TKY6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cwc27Q3TKY6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms