Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xlr4cQ3TKR2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms