Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2afvQ3THW5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms